Ξεκίνησε την διαδρομή του στο μπάσκετ από του Ζωγράφου και τον Φιλαθλητικό, για να συνεχίσει στον Υμηττό και στον Αμύντα και να αγωνιστεί και για μια σεζόν (την περσινή) στο Ψυχικό. Πλέον ο Μπάμπης Σαμοθράκης, στα 31 του χρόνια, παρά την συμμετοχή του στο τεχνικό τιμ του Φιλαθλητικού, αποφάσισε να συνεχίσει την καριέρα του, αποδεχόμενος την πρόταση του κατέθεσε ο ιστορικός Τρίτωνας, ο οποίος μαζί με τον Απόλλωνα Σμύρνης αποτελούν τα φαβορί για την άνοδο τους από την Α’ ΕΣΚΑ.

Ο Σαμοθράκης με την εμπειρία και την ποιότητα του αναμένεται να ενισχύσει τα μέγιστα το συγκρότημα του Μιχάλη Μιχελάκου, ενώ την περσινή σεζόν με το Ψυχικό σε 19 συμμετοχές είχε 6,7 πόντους μέσο όρο και 1,8 ασίστ.